一、了解违规情况

首先，商家需要了解自己的违规情况，了解被扣除积分的具体原因，以便有针对性地采取措施。可以通过淘宝后台的“违规管理”功能查看具体的违规信息。

二、积极整改

商家需要积极整改，遵守淘宝的规定，避免再次出现违规行为。如果是因为商品质量、描述等问题导致的违规，需及时对商品进行整改。如果是因为售后服务不到位导致的违规，需加强售后服务，提高顾客满意度。

三、申诉违规积分

如果商家认为自己的违规积分扣除有误，可以通过淘宝后台的“违规管理”功能进行申诉。申诉时需要提供相关证据，如商品实物图、交易记录等，以证明自己没有违规行为。

四、积极沟通

如果申诉不成功，商家可以通过淘宝客服电话、在线客服等渠道与淘宝客服进行沟通，寻求更多的帮助和支持。

五、积极维权

如果商家认为自己的权益受到侵害，可以通过淘宝的维权平台进行维权。维权平台支持商家对侵权行为进行投诉和维权，以保障自己的合法权益。

总之，商家需要积极应对违规积分扣除问题，遵守淘宝规定，积极整改，申诉违规积分，积极沟通，积极维权，以恢复店铺正常运营。